Le Congrès National est l’instance suprême de l’organisation. Il se tient tous les trois ans en présence de la majorité absolue des congressistes. Sont présents au Congrès National tous les membres élus par les sections comme congressistes. Le nombre des congressistes est fixé par le Bureau National ou par le Conseil National. Le Congrès National étudie et approuve d’une part, toutes les questions culturelles y compris celles relatives à la langue et la culture amazighes ainsi qu’aux droits linguistiques, économiques, sociaux et environnementaux, et d’autre part toutes les questions qui se rapportent aux objectifs de l’Organisation que ceux-ci soient soulevés par le Bureau National, par les bureaux des sections ou par tout membre, et ce après la présentation du rapport moral et financier.

Le Congrès National a le droit d’intégrer des amendements et des changements sur les statuts, et de décider sur toutes les questions soulevées, relevant de ses compétences légales. Les décisions sont prises au Congrès National, et dans toutes les commissions par la majorité absolue des congressistes. L’amendement des statuts de l’organisation nécessite la majorité de deux tiers (2/3).

Avant de démissionner, le Bureau National veille sur l’élection d’un comité qui préside le Congrès et qui comprend: un président et trois (3) membres élu par les congressistes avant la démission du Bureau National. Ce comité veillera au bon déroulement du Congrès y compris l’élection du nouveau Conseil National, puis il démissionne à son tour.